1、微波与被分离物质的直接作用
由于微波具有穿透能力，因而可以直接与样品中有关物质分子或分子中的某个基团作用，被微波作用的分子或基团，很快与整个样品基体或其大分子上的周围环境分离开，从而使分离速度加快并提高萃取率。这种微波与被分离物质的特殊作用，可以称为微波的激活作用。
2、微波萃取使用极性溶剂比用非极性溶剂更有利
因为极性溶剂吸收微波能，从而提高溶剂的活性，使溶剂和样品间的相互作用更有效。
3、应用密闭容器
使微波萃取可在比溶剂沸点高得多的温度下进行，从而显著地提离微波萃取的速率。由于在高的温度和压力下化学反应速率比在低温和常压下高得多，因此，密闭容器带来的高温非常明显地提高了微波萃取的萃取率并减少了制样所需的时间。但是需要指出，错误的操作或不适宜的操作条件容易造成爆炸，使用微波萃取要注意安全。
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